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課程名稱 |
基因體數量分析方法
QUANTITATIVE MEDTHOD GENOMIC RESEARCH |
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開課學期 |
99-1 |
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授課對象 |
學程 系統生物與生物資訊學程 |
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授課教師 |
程蘊菁 |
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課號 |
EPM7174 |
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課程識別碼 |
849 M0690 |
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班次 |
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學分 |
2 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期一5,6(12:20~14:10) |
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上課地點 |
公衛214 |
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備註 |
總人數上限：30人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/991QuantGene |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
本課程主旨在於將讓學生學習實際分析基因相關的資料。課程內容分為三部份：非關聯性研究、家族關聯研究以及系統生物學。針對每一部分，先介紹實驗設計，接下來運用各種遺傳軟體進行實際分析。修課學生以具備遺傳流行病學、生物統計或生物資訊的背景，或相關研究的經驗為佳。學生將需繳交作業與期中、期末報告。
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課程目標 |
訊練學生做基因相關研究的實務分析能力 |
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課程要求 |
英文文獻的閱讀及遺傳分析軟體之操作 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
1) Statistical Methods in Genetic Epidemiology, Duncan C. Thomas Oxford 2004.
2) An Introduction to Genetic Analysis, Griffiths AJF, Miller JH, Suzuki DT, Lewontin RC (Eds.) 8th ed., 2005
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參考書目 |
1) Statistical Methods in Genetic Epidemiology, Duncan C. Thomas Oxford 2004.
2) Human Genome Epidemiology, Khoury MJ, Little J, Burke W (Eds.) Oxford 2004.
3) An Introduction to Genetic Analysis, Griffiths AJF, Miller JH, Suzuki DT,
Lewontin RC (Eds.) 8th ed., 2005
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評量方式
(僅供參考) |
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No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
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1. |
期末報告 |
20% |
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2. |
作業 |
80% |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
2010/09/13 |
前言&非關聯性研究設計 - 程蘊菁老師 |
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第2週 |
2010/09/20 |
遺傳標記(SNP)的選取 - 程蘊菁老師 |
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第3週 |
2010/09/27 |
遺傳半型block與連鎖不平衡(Homework 1) - 程蘊菁老師 |
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第4週 |
2010/10/04 |
單一核苷酸多型性(SNP)分析 - 程蘊菁老師 |
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第5週 |
2010/10/11 |
遺傳半型分析(Homework 2) - 程蘊菁老師 |
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第6週 |
2010/10/18 |
環境與基因之交互作用 - 黃依齡老師 |
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第7週 |
2010/10/25 |
多重測定之校正 (Correction for multiple test) - 國際哈佛 胡賦強老師 |
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第8週 |
2010/11/01 |
全基因關聯研究 (I) - 中研院 陳建勳老師 |
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第9週 |
2010/11/08 |
全基因關聯研究 (II): PLINK (Homework 3) - 中研院 陳建勳老師 |
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第10週 |
2010/11/15 |
校慶放假一天 |
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第11週 |
2010/11/22 |
預測模式 (Prediction model) - 國際哈佛 胡賦強老師 |
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第12週 |
2010/11/29 |
Linkage Analysis及家族關聯分析(I) - 國衛院 王紋璋老師 |
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第13週 |
2010/12/06 |
家族關聯分析(II): FBAT (Homework 4) - 國衛院 王紋璋老師 |
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第14週 |
2010/12/13 |
Gene expression and microRNA - 生物科技所 蔡孟勳老師 |
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第15週 |
2010/12/20 |
期末報告 小組討論 |
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第16週 |
2010/12/27 |
DNA methylation - 生理所 賴亮全老師 |
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第17週 |
2011/01/03 |
Explore potential biological pathway - 生理所 賴亮全老師 |
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第18週 |
2011/01/10 |
期末報告 |
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